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medgemma_script.sh → medgemma.sh

@@ -1,6 +1,6 @@
 #!/bin/bash
 
-#SBATCH --job-name=medgemma3
+#SBATCH --job-name=medgemma2
 #SBATCH -c 4
 #SBATCH --gres=gpu:l40s:1
 #SBATCH --time=16:00:00

rexvqa_script.sh → rexvqa_medrax.sh

@@ -1,10 +1,10 @@
 #!/bin/bash
 
-#SBATCH --job-name=medgemma_run2
+#SBATCH --job-name=medrax
 #SBATCH -c 4
 #SBATCH --gres=gpu:l40s:1
-#SBATCH --time=16:00:00
-#SBATCH --mem=50G
+#SBATCH --time=08:00:00
+#SBATCH --mem=64G
 #SBATCH --output=rexvqa-%j.out
 #SBATCH --error=rexvqa-%j.err
 
@@ -12,4 +12,4 @@ module load arrow clang/18.1.8 scipy-stack
 
 source venv/bin/activate
 
-/scratch/lijunzh3/MedRAX2/venv/bin/python -m benchmarking.cli run --benchmark rexvqa --provider medgemma --model medgemma-4b --system-prompt MEDGEMMA_PROMPT --data-dir benchmarking/data/rexvqa --output-dir temp --max-questions 200 --temperature 0.7 --top-p 0.95 --max-tokens 10000 --concurrency 4 --random-seed 100
+/scratch/lijunzh3/MedRAX2/venv/bin/python -m benchmarking.cli run --benchmark rexvqa --provider medrax --model gemini-3-pro-preview --system-prompt CHESTAGENTBENCH_PROMPT --data-dir benchmarking/data/rexvqa --output-dir temp --max-questions 250 --temperature 0.7 --top-p 0.95 --max-tokens 10000 --concurrency 4 --random-seed 42