OpenBioNER-v2
Collection
Models and data for OpenBioNER-v2
•
9 items
•
Updated
tokens
listlengths 2
219
| ner_tags
listlengths 2
219
|
|---|---|
[
"We",
"analyzed",
"the",
"variation",
"of",
"one",
"nuclear",
"(",
"Gpi",
")",
"and",
"one",
"mitochondrial",
"(",
"Nd1",
")",
"gene",
"among",
"60",
"TcI",
"strains",
"and",
"15",
"reference",
"strains",
"belonging",
"to",
"the",
"six",
"DTUs",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-gene",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-gene",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"results",
"clearly",
"showed",
"that",
"one",
"strain",
"isolated",
"from",
"Triatoma",
"infestans",
"in",
"the",
"Cochabamba",
"department",
"(",
"Bolivia",
")",
"presented",
"a",
"genotype",
"TcI",
"for",
"Gpi",
"and",
"a",
"mitochondrial",
"Nd1",
"genotype",
"common",
"to",
"the",
"DTUs",
"TcIII",
",",
"IV",
",",
"V",
",",
"and",
"VI",
";",
"this",
"can",
"be",
"interpreted",
"as",
"a",
"mitochondrial",
"introgression",
"event",
"between",
"distant",
"DTUs",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-organism",
"I-organism",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-gene",
"O",
"O",
"O",
"B-gene",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Benzene-extracted",
"components",
"are",
"important",
"for",
"the",
"major",
"activity",
"of",
"diesel",
"exhaust",
"particles",
":",
"effect",
"on",
"interleukin-8",
"gene",
"expression",
"in",
"human",
"bronchial",
"epithelial",
"cells",
"."
] |
[
"B-chemical",
"I-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell type",
"I-cell type",
"I-cell type",
"I-cell type",
"O"
] |
[
"We",
"used",
"several",
"agents",
"active",
"on",
"signal",
"transduction",
"pathways",
"in",
"cytokine",
"expression",
",",
"such",
"as",
"the",
"protein",
"kinase",
"C",
"inhibitor",
"staurosporin",
",",
"antioxidant",
"agents",
"including",
"N-acetyl",
"cysteine",
"(",
"NAC",
")",
"and",
"pyrrolidine",
"dithiocarbamate",
"(",
"PDTC",
")",
",",
"and",
"p38",
"mitogen-activated",
"protein",
"kinase",
"(",
"MAPK",
")",
"inhibitor",
"SB203580",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-drug",
"I-drug",
"I-drug",
"I-drug",
"I-drug",
"O",
"B-drug",
"I-drug",
"O",
"B-drug",
"I-drug",
"I-drug",
"I-drug",
"I-drug",
"O",
"B-drug",
"I-drug",
"I-drug",
"I-drug",
"I-drug",
"O",
"O",
"B-drug",
"I-drug",
"I-drug",
"I-drug",
"I-drug",
"I-drug",
"I-drug",
"I-drug",
"I-drug",
"O"
] |
[
"[",
"Functional",
"results",
"obtained",
"by",
"radium",
"contact",
"irradiation",
"of",
"the",
"glottic",
"carcinoma",
"]",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-treatment",
"I-treatment",
"I-treatment",
"O",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"O",
"O"
] |
[
"45",
"patients",
"having",
"been",
"treated",
"with",
"radium",
"contact",
"irradiation",
"on",
"account",
"of",
"a",
"glottic",
"carcinoma",
"were",
"continually",
"checked",
"up",
"with",
"a",
"view",
"to",
"ascertaining",
"the",
"functional",
"results",
"obtained",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-treatment",
"I-treatment",
"I-treatment",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"456",
"strains",
"identified",
"included",
"12",
"different",
"genera",
",",
"with",
"a",
"clear",
"predominance",
"(",
"68",
"%",
")",
"of",
"Penicillium",
",",
"Aspergillus",
",",
"Trichoderma",
"and",
"Cladosporium",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-organism",
"O",
"B-organism",
"O",
"B-organism",
"O",
"B-organism",
"O"
] |
[
"There",
"were",
"59",
"cases",
"of",
"measles",
"of",
"which",
"49",
"were",
"over",
"5",
"years",
"of",
"age",
",",
"the",
"mean",
"age",
"being",
"8.8",
"years",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Thrombophilia",
"and",
"pregnancy",
"complications",
"."
] |
[
"B-medical condition",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O"
] |
[
"Since",
"pregnancy",
"is",
"an",
"acquired",
"hypercoagulable",
"state",
",",
"women",
"harboring",
"thrombophilia",
"may",
"present",
"with",
"clinical",
"symptoms",
"of",
"vascular",
"complications",
"for",
"the",
"first",
"time",
"during",
"gestation",
"or",
"at",
"the",
"postpartum",
"period",
"(",
"1",
")",
"."
] |
[
"O",
"B-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Women",
"with",
"thrombophilia",
"may",
"have",
"an",
"increased",
"risk",
"of",
"placental",
"vascular",
"complications",
",",
"including",
"pregnancy",
"loss",
",",
"preeclampsia",
",",
"intrauterine",
"growth",
"restriction",
",",
"and",
"placental",
"abruption",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"B-medical condition",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O"
] |
[
"Accumulating",
"data",
"suggest",
"that",
"maternal",
"antithrombotic",
"prophylaxis",
"may",
"result",
"in",
"improved",
"gestational",
"outcome",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical treatment",
"I-medical treatment",
"I-medical treatment",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O"
] |
[
"The",
"α2-adrenergic",
"receptor",
"is",
"required",
"for",
"enhanced",
"adherence",
"and",
"internalization",
"."
] |
[
"O",
"B-protein",
"I-protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Klebsiella",
"pneumoniae",
",",
"serovar",
"K1",
"strains",
",",
"differ",
"essentially",
"in",
"the",
"composition",
"of",
"cellular",
"fatty",
"acids",
"from",
"serovar",
"strains",
"K",
"2",
",",
"K",
"3",
",",
"K",
"7-K",
"72",
",",
"K",
"74-K",
"80",
"of",
"this",
"species",
"and",
"are",
"analogous",
"to",
"K.",
"rhinoscleromatis",
"and",
"K.",
"ozaenae",
"by",
"the",
"given",
"trait",
"."
] |
[
"B-organism",
"I-organism",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-organism",
"I-organism",
"O",
"B-organism",
"I-organism",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"[",
"The",
"usefulness",
"of",
"Doppler",
"sonography",
"in",
"the",
"assessment",
"of",
"disease",
"activity",
"of",
"ulcerative",
"colitis",
"]",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical test",
"I-medical test",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"study",
",",
"we",
"compared",
"disease",
"activity",
"of",
"UC",
"as",
"determined",
"by",
"clinical",
"features",
"and",
"endoscopic",
"findings",
",",
"and",
"aimed",
"to",
"assess",
"the",
"clinical",
"usefulness",
"of",
"Doppler",
"sonography",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical test",
"I-medical test",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical test",
"I-medical test",
"O"
] |
[
"Metformin",
"use",
"increased",
"by",
"97.0",
"%",
"to",
"60.4",
"million",
"prescriptions",
"dispensed",
"in",
"retail",
"pharmacies",
"in",
"2012",
"."
] |
[
"B-drug",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Rosiglitazone",
"use",
"plummeted",
"to",
"<",
"13,000",
"prescriptions",
"dispensed",
"in",
"retail",
"or",
"mail-order",
"pharmacies",
"in",
"2012",
"."
] |
[
"B-drug",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"61-year-old",
"woman",
"with",
"a",
"focus",
"of",
"lamellar",
"bone",
"with",
"bone-marrow",
"in",
"the",
"corium",
"of",
"the",
"forehead",
"skin",
",",
"the",
"socalled",
"Osteoma",
"Cutis",
"is",
"reported",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-anatomical structure",
"I-anatomical structure",
"O",
"B-anatomical structure",
"O",
"O",
"B-anatomical structure",
"O",
"O",
"B-anatomical structure",
"I-anatomical structure",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Osteosis",
"Cutis",
"Faciei",
"is",
"a",
"rare",
"and",
"a",
"harmless",
"illness",
"occurring",
"in",
"women",
"aged",
"40-80",
"."
] |
[
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"therapy",
"of",
"the",
"cutaneous",
"bone",
"structure",
"is",
"confined",
"to",
"biopsy",
"excision",
"with",
"a",
"good",
"margin",
"of",
"healthy",
"tissue",
"."
] |
[
"O",
"B-medical treatment",
"O",
"O",
"O",
"B-anatomical structure",
"I-anatomical structure",
"O",
"O",
"O",
"B-medical treatment",
"I-medical treatment",
"O",
"O",
"O",
"B-anatomical structure",
"I-anatomical structure",
"I-anatomical structure",
"I-anatomical structure",
"O"
] |
[
"In",
"a",
"review",
"paper",
"written",
"by",
"a",
"group",
"of",
"28",
"scientists",
"from",
"both",
"academic",
"and",
"industrial",
"backgrounds",
",",
"the",
"authors",
"encouraged",
"the",
"``",
"investigation",
"of",
"nonantibiotic",
"approaches",
"for",
"the",
"prevention",
"of",
"and",
"protection",
"against",
"infectious",
"diseases",
"\"''\"",
".^",
"[",
"@",
"ref1",
"]",
"^",
"In",
"this",
"regard",
",",
"cold",
"atmospheric",
"plasma",
"(",
"CAP",
")",
"has",
"come",
"into",
"the",
"spotlight",
"as",
"a",
"new",
"alternative",
"approach",
"for",
"nonsystemic",
"infection",
"as",
"it",
"shows",
"effectiveness",
"in",
"inactivating",
"a",
"range",
"of",
"microorganisms",
",",
"including",
"antibiotic-resistant",
"biofilm-forming",
"strains",
"and",
"spores",
",",
"^",
"[",
"@",
"ref2",
"]",
"^",
"and",
"in",
"reduction",
"of",
"bacterial",
"load",
"in",
"chronic",
"wounds.^",
"[",
"@",
"ref3",
"]",
",",
"[",
"@",
"ref4",
"]",
"^",
"CAP",
"refers",
"to",
"a",
"partially",
"ionized",
"gas",
"generated",
"by",
"electrical",
"discharges",
",",
"whose",
"temperature",
"is",
"close",
"to",
"room",
"temperature",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical treatment",
"I-medical treatment",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical treatment",
"I-medical treatment",
"I-medical treatment",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-organism",
"O",
"O",
"O",
"B-organism",
"I-organism",
"O",
"B-organism",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-substance",
"I-substance",
"I-substance",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"There",
"was",
"no",
"mortality",
"or",
"morbidity",
"associated",
"with",
"delayed",
"treatment",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"O",
"B-medical condition",
"O",
"O",
"B-medical procedure",
"I-medical procedure",
"O"
] |
[
"Hemin",
"potentiates",
"nitric",
"oxide-mediated",
"nitrosation",
"of",
"2-amino-3-methylimidazo",
"[",
"4,5-f",
"]",
"quinoline",
"(",
"IQ",
")",
"to",
"2-nitrosoamino-3-methylimidazo",
"[",
"4,5-f",
"]",
"quinoline",
"."
] |
[
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"study",
"uses",
"the",
"heterocyclic",
"amine",
"2-amino-3-methylimidazo",
"[",
"4,5-f",
"]",
"quinoline",
"(",
"IQ",
")",
"as",
"a",
"target",
"to",
"evaluate",
"hemin",
"potentiation",
"of",
"nitric",
"oxide",
"(",
"NO",
")",
"-mediated",
"nitrosation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"I-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Hyperthyroidism",
"in",
"molar",
"pregnancy",
":",
"rapid",
"preoperative",
"preparation",
"by",
"plasmapheresis",
"and",
"complete",
"improvement",
"after",
"evacuation",
"."
] |
[
"B-medical condition",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical treatment",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical treatment",
"O"
] |
[
"We",
"describe",
"a",
"patient",
"with",
"molar",
"pregnancy",
"who",
"had",
"secondary",
"hyperthyroidism",
"prepared",
"rapidly",
"by",
"plasmapheresis",
"for",
"surgery",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"B-medical treatment",
"O",
"B-medical treatment",
"O"
] |
[
"This",
"is",
"the",
"first",
"use",
"of",
"plasmapheresis",
"in",
"rapid",
"preparation",
"of",
"a",
"patient",
"who",
"had",
"secondary",
"hyperthyroidism",
"due",
"to",
"molar",
"pregnancy",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical treatment",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O"
] |
[
"Minimization",
"of",
"immunosuppressive",
"therapy",
"after",
"renal",
"transplantation",
":",
"results",
"of",
"a",
"randomized",
"controlled",
"trial",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-treatment",
"I-treatment",
"O",
"B-medical procedure",
"I-medical procedure",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"N-",
"(",
"X-chlorophenyl",
")",
"-4-hydroxy-2-methyl-2H-1,2-benzothiazine-3-carboxamide",
"1,1-dioxide",
"(",
"with",
"X",
"=",
"2",
"and",
"4",
")",
"."
] |
[
"B-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"structures",
"of",
"N-",
"(",
"2-chlorophenyl",
")",
"-4-hydroxy-2-methyl-2H-1,2-benzothiazine-3-carboxamide",
"1,1-dioxide",
"and",
"N-",
"(",
"4-chlorophenyl",
")",
"-4-hydroxy-2-methyl-2H-1,2-benzothiazine-3-carboxamide",
"1,1-dioxide",
",",
"both",
"C16H13ClN2O4S",
",",
"are",
"stabilized",
"by",
"extensive",
"intramolecular",
"hydrogen",
"bonds",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"O",
"B-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"O"
] |
[
"A",
"rapid",
"diagnosis",
"should",
"now",
"be",
"possible",
"by",
"ultrasound",
"imaging",
"of",
"the",
"dilated",
"intra-",
"and",
"extra-hepatic",
"biliary",
"pathways",
",",
"complemented",
"by",
"either",
"fibroscopy",
"with",
"or",
"without",
"retrograde",
"catheterization",
"or",
"trans-parieto-hepatic-cholangiography",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-procedure",
"I-procedure",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-procedure",
"O",
"O",
"O",
"B-procedure",
"I-procedure",
"O",
"B-procedure",
"O"
] |
[
"S100A2",
"protein",
"and",
"non-small",
"cell",
"lung",
"cancer",
"."
] |
[
"B-protein",
"I-protein",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"I-disease",
"I-disease",
"O"
] |
[
"Its",
"role",
"has",
"been",
"recently",
"implicated",
"in",
"carcinogenesis",
"and",
"metastasis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-biological process",
"O",
"B-biological process",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"intestine",
",",
"butyrate",
"constitutes",
"the",
"major",
"energy",
"fuel",
"for",
"colonocytes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-organ",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell type",
"O"
] |
[
"However",
",",
"little",
"is",
"known",
"about",
"the",
"transport",
"of",
"butyrate",
"and",
"its",
"regulation",
"in",
"the",
"intestine",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-organ",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"study",
"we",
"demonstrate",
"that",
"the",
"monocarboxylate",
"transporter",
"(",
"MCT-1",
")",
"is",
"apically",
"polarized",
"in",
"model",
"human",
"intestinal",
"epithelia",
"and",
"is",
"involved",
"in",
"butyrate",
"uptake",
"by",
"Caco2-BBE",
"cell",
"monolayers",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein",
"I-protein",
"O",
"B-protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Using",
"antisense",
"CD147",
",",
"we",
"demonstrate",
"that",
"the",
"association",
"of",
"CD147",
"with",
"MCT-1",
"is",
"critical",
"for",
"the",
"butyrate",
"transport",
"activity",
"."
] |
[
"O",
"B-protein",
"I-protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein",
"O",
"B-protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Activation",
"of",
"protein",
"kinase",
"C",
"by",
"purified",
"bovine",
"brain",
"14-3-3",
":",
"comparison",
"with",
"tyrosine",
"hydroxylase",
"activation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-protein",
"I-protein",
"I-protein",
"O",
"O",
"B-protein",
"I-protein",
"I-protein",
"O",
"O",
"O",
"B-protein",
"I-protein",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"concentration",
"dependence",
"of",
"PKC",
"activation",
"by",
"14-3-3",
"is",
"in",
"the",
"same",
"range",
"as",
"that",
"shown",
"previously",
"for",
"KCIP",
"inhibition",
"of",
"PKC",
",",
"and",
"as",
"that",
"required",
"for",
"14-3-3",
"activation",
"of",
"tyrosine",
"hydroxylase",
";",
"a",
"maximal",
"stimulation",
"of",
"two-",
"to",
"three-fold",
"occurs",
"at",
"40-100",
"micrograms/ml",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein",
"O",
"O",
"B-protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein",
"I-protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Radicular",
"lesions",
"in",
"tuberculous",
"meningitis",
"."
] |
[
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"present",
"work",
",",
"the",
"involvement",
"of",
"cranial",
"and",
"spinal",
"nerve",
"roots",
"in",
"tuberculous",
"meningitis",
"was",
"studied",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-anatomical structure",
"I-anatomical structure",
"I-anatomical structure",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Cranial",
"nerves",
"of",
"11",
"cases",
"and",
"the",
"spinal",
"roots",
"of",
"three",
"patients",
"were",
"examined",
"by",
"means",
"of",
"serial",
"sections",
"of",
"the",
"base",
"of",
"the",
"brain",
",",
"brainstem",
"and",
"spinal",
"cord",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-anatomical structure",
"O",
"B-anatomical structure",
"O",
"B-anatomical structure",
"I-anatomical structure",
"O"
] |
[
"Although",
"entrapment",
"of",
"the",
"nerves",
"by",
"the",
"tenacious",
"inflammatory",
"exudate",
"was",
"prominent",
",",
"vasculitis",
"lesions",
"of",
"the",
"cranial",
"nerves",
"and",
"spinal",
"roots",
"were",
"also",
"frequently",
"observed",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"B-anatomical structure",
"I-anatomical structure",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"latter",
"could",
"be",
"an",
"additional",
"cause",
"of",
"nerve",
"palsies",
"in",
"tuberculous",
"meningitis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O"
] |
[
"Debunking",
"the",
"myths",
"to",
"provide",
"21st",
"Century",
"management",
"of",
"gout",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"O"
] |
[
"Epidemiologic",
"and",
"recent",
"qualitative",
"research",
"suggests",
"that",
"the",
"impact",
"of",
"under-treated",
"gout",
"is",
"far",
"more",
"significant",
"than",
"many",
"health",
"professionals",
"realise",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"Group",
"wishes",
"to",
"support",
"further",
"research",
"into",
"the",
"impact",
"and",
"causes",
"of",
"gout",
",",
"particularly",
"for",
"Maaori",
",",
"and",
"to",
"develop",
"strategic",
"alliances",
"to",
"ensure",
"that",
"the",
"treatment",
"and",
"prevention",
"of",
"gout",
"is",
"advocated",
"by",
"those",
"working",
"with",
"conditions",
"such",
"as",
"diabetes",
"and",
"cardiovascular",
"disease",
"where",
"gout",
"is",
"a",
"frequent",
"comorbidity",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"O",
"B-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Meanwhile",
",",
"acidosis",
"and",
"hypoxia",
"can",
"predispose",
"to",
"pulmonary",
"hemorrhage",
"and",
"disseminated",
"intravascular",
"coagulation",
"(",
"DIC",
")",
"\\\\",
"[",
"[",
"@",
"B4",
"]",
"\\\\",
"]",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-medical condition",
"O",
"B-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"B-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Non-exposed",
"bisphosphonate-related",
"osteonecrosis",
"of",
"the",
"jaw",
"(",
"BRONJ",
")",
"is",
"a",
"newly",
"reported",
"complication",
"arising",
"from",
"bisphosphonate",
"therapy",
"that",
"presents",
"with",
"atypical",
"symptoms",
"and",
"no",
"apparent",
"mucosal",
"fenestration",
"or",
"exposure",
"of",
"necrotic",
"bone",
"."
] |
[
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"I-medical condition",
"I-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"B-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"O",
"O",
"B-medical treatment",
"I-medical treatment",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O"
] |
[
"Hence",
",",
"the",
"purpose",
"of",
"this",
"review",
"is",
"to",
"critically",
"assess",
"the",
"current",
"guidelines",
"for",
"diagnosis",
"and",
"management",
"of",
"BRONJ",
"and",
"propose",
"a",
"modified",
"staging",
"system",
"and",
"treatment",
"guidelines",
"to",
"properly",
"address",
"the",
"non-exposed",
"variant",
"of",
"BRONJ",
"lesions",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical procedure",
"O",
"B-medical procedure",
"O",
"B-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical procedure",
"I-medical procedure",
"O",
"B-medical procedure",
"I-medical procedure",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"study",
"group",
"consisted",
"of",
"74",
"children",
"with",
"energy",
"malnutrition",
"(",
"marasmus",
")",
",",
"and",
"the",
"control",
"group",
"consisted",
"of",
"47",
"healthy",
"children",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"O",
"B-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"hereditary",
"spastic",
"paraplegias",
"(",
"HSPs",
")",
"are",
"a",
"group",
"of",
"genetic",
"neurodegenenerative",
"disorders",
"affecting",
"the",
"neurons",
"of",
"the",
"corticospinal",
"tract",
"."
] |
[
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"I-disease",
"O",
"B-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"O",
"O",
"B-anatomy",
"O",
"O",
"B-anatomy",
"I-anatomy",
"O"
] |
[
"Neuropathologically",
",",
"HSPs",
"show",
"a",
"length-dependent",
"distal",
"degeneration",
"of",
"the",
"axons",
"of",
"these",
"neurons",
",",
"causing",
"progressive",
"spastic",
"paralysis",
"affecting",
"the",
"legs",
"[",
"@",
"b1",
"]",
",",
"[",
"@",
"b2",
"]",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-process",
"O",
"O",
"B-anatomy",
"O",
"O",
"B-anatomy",
"O",
"O",
"O",
"B-symptom",
"I-symptom",
"O",
"O",
"B-anatomy",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"mutational",
"spectrum",
"is",
"broad",
"and",
"includes",
"large",
"deletions",
"(",
"sometimes",
"encompassing",
"the",
"entire",
"coding",
"region",
")",
",",
"suggesting",
"that",
"in",
"many",
"cases",
"the",
"pathological",
"mechanism",
"is",
"haploinsufficiency",
"[",
"@",
"b5",
"]",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-process",
"I-process",
"O",
"B-process",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"OCT-documented",
"optic",
"atrophy",
"in",
"nonsyndromic",
"craniosynostosis",
"and",
"lacunar",
"skull",
"."
] |
[
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O"
] |
[
"He",
"did",
"not",
"complain",
"of",
"headache",
",",
"vomiting",
",",
"or",
"blurred",
"vision",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"O",
"B-medical condition",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O"
] |
[
"HD-OCT",
"imaging",
"revealed",
"optic",
"neuropathy",
"in",
"both",
"eyes",
"."
] |
[
"B-medical test",
"I-medical test",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"patient",
"underwent",
"sutural",
"release",
"and",
"expansion",
"cranioplasty",
"surgery",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-medical procedure",
"I-medical procedure",
"I-medical procedure",
"I-medical procedure",
"I-medical procedure",
"I-medical procedure",
"O"
] |
[
"Tay-Sachs",
"disease",
"has",
"been",
"reported",
"to",
"be",
"more",
"prevalent",
"in",
"the",
"Cajun",
"population",
"of",
"Louisiana",
"."
] |
[
"B-disease",
"I-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Of",
"the",
"151",
"responding",
"physicians",
",",
"95",
"(",
"63",
"%",
")",
"reported",
"that",
"they",
"do",
"not",
"routinely",
"screen",
"their",
"prenatal",
"patients",
"for",
"Tay-Sachs",
"disease",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"O"
] |
[
"However",
",",
"the",
"regulatory",
"mechanisms",
"and",
"the",
"role",
"of",
"STIM1",
"in",
"paraquat",
"(",
"PQ",
")",
"-induced",
"acute",
"lung",
"intoxication",
"remain",
"elusive",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein",
"O",
"B-chemical compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"stomach",
",",
"intestine",
"and",
"uterus",
"were",
"contracted",
"by",
"PGE1",
"."
] |
[
"O",
"B-anatomical_structure",
"O",
"B-anatomical_structure",
"O",
"B-anatomical_structure",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Stimulating",
"effects",
"of",
"ACh",
"and",
"serotonin",
"were",
"augmented",
"in",
"some",
"of",
"these",
"organs",
",",
"especially",
"in",
"guinea",
"pig",
"uterus",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-anatomical_structure",
"I-anatomical_structure",
"I-anatomical_structure",
"O"
] |
[
"Calcitriol",
"has",
"an",
"intracellular",
"receptor",
"(",
"VDR",
")",
"that",
",",
"as",
"a",
"heterodimer",
"with",
"Retinoid-X",
"receptor",
",",
"regulates",
"gene",
"expression",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-protein",
"I-protein",
"O",
"B-protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein",
"I-protein",
"O",
"O",
"B-process",
"I-process",
"O"
] |
[
"Here",
",",
"we",
"present",
"a",
"case",
"of",
"esophageal",
"pneumatosis",
"in",
"the",
"setting",
"of",
"upper",
"gastrointestinal",
"and",
"small",
"bowel",
"ileus",
",",
"diagnosed",
"on",
"computed",
"tomography",
"(",
"CT",
")",
"with",
"subsequent",
"acute",
"resolution",
"after",
"nasogastric",
"tube",
"decompression",
",",
"confirmed",
"on",
"interval",
"CT",
"just",
"11",
"hours",
"after",
"the",
"initial",
"diagnosis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"B-medical test",
"I-medical test",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical procedure",
"I-medical procedure",
"I-medical procedure",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"paper",
"presents",
"a",
"case",
"of",
"successful",
"management",
"of",
"extensive",
",",
"symptomatic",
"atrophic",
"OLP",
"with",
"a",
"novel",
"treatment",
"protocol",
":",
"oral",
"mini",
"pulse",
"therapy",
"with",
"betamethasone",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"I-disease",
"I-disease",
"I-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-drug",
"O"
] |
[
"The",
"value",
"of",
"echocardiography",
"in",
"the",
"early",
"diagnosis",
"of",
"myocardial",
"impairment",
"due",
"to",
"connective",
"tissue",
"diseases",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-medical test",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"I-medical condition",
"O"
] |
[
"The",
"study",
"comprised",
"14",
"patients",
"with",
"systemic",
"lupus",
"erythematosus",
"(",
"SLE",
")",
"and",
"12",
"patients",
"with",
"diffuse",
"scleroderma",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O"
] |
[
"The",
"authors",
"specify",
"two",
"important",
"echocardiographic",
"variables",
":",
"the",
"E-septum",
"distance",
"and",
"the",
"septal",
"and",
"wall",
"motion",
"after",
"amyl-nitrite",
"test",
",",
"which",
"reveal",
"the",
"intrinsic",
"contractile",
"properties",
"of",
"the",
"myocardium",
",",
"allowing",
"an",
"early",
"diagnosis",
"of",
"myocardial",
"impairment",
",",
"as",
"well",
"as",
"the",
"selection",
"of",
"patients",
"for",
"an",
"efficient",
"treatment",
"with",
"vasodilator",
"drugs",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical test",
"I-medical test",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-anatomical structure",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"I-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical treatment",
"I-medical treatment",
"O"
] |
[
"Enzymic",
"oxidation",
"of",
"dihydrostreptomycin",
"(",
"6-phosphate",
")",
"to",
"streptomycin",
"(",
"6-phosphate",
")",
"with",
"a",
"particulate",
"fraction",
"of",
"Streptomyces",
"griseus",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-organism",
"I-organism",
"O"
] |
[
"Resting",
"cells",
"and",
"to",
"a",
"greater",
"extent",
"permeabilized",
"cells",
"of",
"Streptomyces",
"griseus",
"can",
"oxidize",
"dihydrostreptomycin",
"to",
"streptomycin",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-organism",
"I-organism",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"B-chemical",
"O"
] |
[
"MicroRNAs",
"involved",
"in",
"the",
"HMGA2",
"deregulation",
"and",
"its",
"co-occurrence",
"with",
"MED12",
"mutation",
"in",
"uterine",
"leiomyoma",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-gene",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-gene",
"O",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"O"
] |
[
"The",
"co-occurrence",
"of",
"MED12",
"mutation",
"and",
"HMGA2",
"overexpression",
",",
"and",
"a",
"negative",
"correlation",
"of",
"five",
"validated",
"or",
"predicted",
"microRNAs",
"that",
"target",
"HMGA2",
"were",
"reported",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-gene",
"O",
"O",
"B-gene",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-gene",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Common",
"mechanisms",
"of",
"monoacylglycerol",
"and",
"fatty",
"acid",
"uptake",
"by",
"human",
"intestinal",
"Caco-2",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"B-chemical",
"I-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Free",
"fatty",
"acids",
"(",
"FFA",
")",
"and",
"sn-2-monoacylglycerol",
"(",
"sn-2-MG",
")",
",",
"the",
"two",
"hydrolysis",
"products",
"of",
"dietary",
"triacylglycerol",
",",
"are",
"absorbed",
"from",
"the",
"lumen",
"into",
"polarized",
"enterocytes",
"that",
"line",
"the",
"small",
"intestine",
"."
] |
[
"B-chemical",
"I-chemical",
"I-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell type",
"O",
"O",
"O",
"B-organ",
"I-organ",
"O"
] |
[
"Role",
"of",
"voltage-gated",
"potassium",
"channels",
"in",
"the",
"fate",
"determination",
"of",
"embryonic",
"stem",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-protein",
"I-protein",
"I-protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell type",
"I-cell type",
"I-cell type",
"O"
] |
[
"Possible",
"reasons",
"for",
"this",
"attenuation",
",",
"including",
"cytotoxicity",
",",
"cell",
"cycle",
"arrest",
"and",
"differentiation",
",",
"were",
"examined",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-process",
"O",
"B-process",
"I-process",
"I-process",
"O",
"B-process",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"relatively",
"low",
"seropositivity",
"was",
"observed",
"in",
"25",
"cases",
"of",
"pleural",
"tuberculosis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"O"
] |
[
"The",
"corresponding",
"figures",
"in",
"130",
"cases",
"of",
"extrapulmonary",
"tuberculosis",
"were",
"22.3",
"%",
",",
"68.4",
"%",
",",
"73.8",
"%",
"and",
"86.15",
"%",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Cerebrolysin",
":",
"a",
"review",
"of",
"its",
"use",
"in",
"dementia",
"."
] |
[
"B-drug",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"O"
] |
[
"In",
"several",
"randomized",
",",
"double-blind",
"trials",
"of",
"up",
"to",
"28",
"weeks",
"\"'\"",
"duration",
"in",
"patients",
"with",
"Alzheimer",
"\"'s\"",
"disease",
",",
"Cerebrolysin",
"was",
"superior",
"to",
"placebo",
"in",
"improving",
"global",
"outcome",
"measures",
"and",
"cognitive",
"ability",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"I-disease",
"O",
"B-drug",
"O",
"O",
"O",
"B-drug",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"large",
",",
"randomized",
"comparison",
"of",
"Cerebrolysin",
",",
"donepezil",
"or",
"combination",
"therapy",
"showed",
"beneficial",
"effects",
"on",
"global",
"measures",
"and",
"cognition",
"for",
"all",
"three",
"treatment",
"groups",
"compared",
"with",
"baseline",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-drug",
"O",
"B-drug",
"O",
"B-treatment",
"I-treatment",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Although",
"not",
"as",
"extensively",
"studied",
"in",
"patients",
"with",
"vascular",
"dementia",
",",
"Cerebrolysin",
"has",
"also",
"shown",
"beneficial",
"effects",
"on",
"global",
"measures",
"and",
"cognition",
"in",
"this",
"patient",
"population",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"B-disease",
"O",
"B-drug",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Cerebrolysin",
"was",
"generally",
"well",
"tolerated",
"in",
"clinical",
"trials",
",",
"with",
"dizziness",
"(",
"or",
"vertigo",
")",
"being",
"the",
"most",
"frequently",
"reported",
"adverse",
"event",
"."
] |
[
"B-drug",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-symptom",
"O",
"O",
"B-symptom",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Although",
"further",
"studies",
"with",
"Cerebrolysin",
",",
"including",
"longer",
"term",
"trials",
"and",
"further",
"exploration",
"of",
"its",
"use",
"in",
"combination",
"with",
"cholinesterase",
"inhibitors",
",",
"are",
"needed",
"to",
"more",
"clearly",
"determine",
"its",
"place",
"in",
"the",
"management",
"of",
"Alzheimer",
"\"'s\"",
"disease",
"and",
"vascular",
"dementia",
",",
"available",
"data",
"suggest",
"that",
"Cerebrolysin",
"is",
"a",
"useful",
"addition",
"to",
"the",
"treatment",
"options",
"available",
"for",
"dementia",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-drug",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-drug",
"I-drug",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-process",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"I-disease",
"O",
"B-disease",
"B-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-drug",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-process",
"I-process",
"O",
"O",
"B-disease",
"O"
] |
[
"Typically",
"the",
"ear",
"canal",
"comprises",
"a",
"concha",
"portion",
"which",
"can",
"be",
"thought",
"of",
"as",
"the",
"outer",
"bowl",
"of",
"the",
"ear",
"located",
"behind",
"the",
"tragus",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-anatomy",
"I-anatomy",
"O",
"O",
"B-anatomy",
"I-anatomy",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-anatomy",
"O"
] |
[
"Heme",
"synthesis",
"in",
"the",
"bone",
"marrow",
"of",
"rats",
"with",
"an",
"acute",
"myelogenous",
"leukemia",
"(",
"Shay",
"Chloroleukemia",
")",
"is",
"substantially",
"reduced",
"in",
"the",
"early",
"as",
"well",
"as",
"the",
"later",
"stages",
"of",
"the",
"disease",
"suggesting",
"that",
"mechanisms",
"other",
"than",
"encroachment",
"by",
"leukemic",
"elements",
"on",
"the",
"hematopoietic",
"compartment",
"are",
"operating",
"to",
"reduce",
"erythrocytopoiesis",
"."
] |
[
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"B-anatomical_structure",
"I-anatomical_structure",
"O",
"B-organism",
"O",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"I-disease",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"proposed",
"studies",
"are",
"designed",
"to",
"determine",
":",
"(",
"1",
")",
"the",
"responsivity",
"of",
"leukemic",
"bone",
"marrow",
"and",
"spleen",
"cultures",
"to",
"erythropoietin",
"as",
"measured",
"by",
"the",
"effect",
"of",
"the",
"hormone",
"on",
"radioiron",
"incorporation",
"into",
"heme",
",",
"labeled",
"nucleotide",
"incorporation",
"into",
"RNA",
":",
"(",
"2",
")",
"the",
"numbers",
"of",
"erythroid",
"precursor",
"(",
"ECFU",
")",
"elements",
"in",
"leukemic",
"bone",
"marrow",
"and",
"spleen",
":",
"(",
"3",
")",
"changes",
"in",
"ALA-Synthetase",
"activity",
"of",
"leukemic",
"hematopoietic",
"tissues",
":",
"and",
"(",
"4",
")",
"the",
"effect",
"of",
"leukemic",
"cell",
"products",
"on",
"heme",
"synthesis",
"by",
"normal",
"bone",
"marrow",
"cell",
"suspensions",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-anatomical_structure",
"I-anatomical_structure",
"I-anatomical_structure",
"O",
"B-anatomical_structure",
"I-anatomical_structure",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"I-chemical",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-anatomical_structure",
"I-anatomical_structure",
"I-anatomical_structure",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"B-anatomical_structure",
"I-anatomical_structure",
"I-anatomical_structure",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-anatomical_structure",
"I-anatomical_structure",
"I-anatomical_structure",
"I-anatomical_structure",
"I-anatomical_structure",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"hoped",
"that",
"this",
"multifaceted",
"approach",
"will",
"help",
"elucidate",
"the",
"alterations",
"in",
"the",
"physiological",
"controls",
"on",
"erythropoiesis",
"operative",
"during",
"the",
"leukemic",
"state",
"and",
"in",
"this",
"way",
",",
"gain",
"some",
"insight",
"into",
"the",
"mechanisms",
"of",
"anemia",
"associated",
"with",
"human",
"granulocytic",
"leukemias",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"O",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"I-disease",
"O"
] |
[
"Estrogen",
"\"'s\"",
"attenuating",
"effect",
"on",
"the",
"exercise",
"pressor",
"reflex",
"is",
"more",
"opioid",
"dependent",
"in",
"gonadally",
"intact",
"than",
"in",
"ovariectomized",
"female",
"cats",
"."
] |
[
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-biological process",
"I-biological process",
"I-biological process",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-organism",
"I-organism",
"O"
] |
[
"Using",
"gonadally",
"intact",
"female",
"cats",
",",
"we",
"showed",
"previously",
"that",
"estrogen",
",",
"applied",
"topically",
"to",
"the",
"spinal",
"cord",
",",
"attenuated",
"the",
"exercise",
"pressor",
"reflex",
"."
] |
[
"O",
"B-organism",
"I-organism",
"I-organism",
"I-organism",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-anatomical structure",
"I-anatomical structure",
"O",
"O",
"O",
"B-biological process",
"I-biological process",
"I-biological process",
"O"
] |
[
"These",
"findings",
"prompted",
"us",
"to",
"test",
"the",
"hypothesis",
"that",
"opioids",
"mediate",
"the",
"attenuating",
"effect",
"of",
"estrogen",
"on",
"the",
"exercise",
"pressor",
"reflex",
"in",
"both",
"gonadally",
"intact",
"female",
"and",
"ovariectomized",
"cats",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"B-biological process",
"I-biological process",
"I-biological process",
"O",
"O",
"B-organism",
"I-organism",
"I-organism",
"O",
"B-organism",
"I-organism",
"O"
] |
[
"We",
"therefore",
"applied",
"200",
"microl",
"of",
"17beta-estradiol",
"(",
"0.01",
"microg/ml",
")",
"with",
"and",
"without",
"the",
"addition",
"of",
"1,000",
"microg",
"naloxone",
",",
"a",
"mu-",
"and",
"delta-opioid",
"antagonist",
",",
"to",
"a",
"spinal",
"well",
"covering",
"the",
"L6-S1",
"spinal",
"cord",
"in",
"decerebrated",
"female",
"cats",
"that",
"were",
"either",
"gonadally",
"intact",
"or",
"ovariectomized",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-chemical",
"I-chemical",
"O",
"O",
"O",
"B-anatomical structure",
"I-anatomical structure",
"O",
"O",
"B-anatomical structure",
"I-anatomical structure",
"I-anatomical structure",
"O",
"B-organism",
"I-organism",
"I-organism",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Cryoglobulinemia",
"and",
"renal",
"disease",
"."
] |
[
"B-disease",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"O"
] |
[
"Cryoglobulinemia",
"occurs",
"in",
"a",
"variety",
"of",
"clinical",
"settings",
"including",
"lymphoproliferative",
"disorders",
",",
"infection",
"and",
"autoimmune",
"disease",
"."
] |
[
"B-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"O",
"B-disease",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"O"
] |
[
"Most",
"of",
"these",
"patients",
"will",
"not",
"have",
"overt",
"renal",
"disease",
",",
"but",
"there",
"is",
"a",
"population",
"of",
"unknown",
"size",
"of",
"patients",
"with",
"subclinical",
"glomerular",
"disease",
"that",
"has",
"the",
"potential",
"to",
"become",
"clinically",
"significant",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-disease",
"I-disease",
"I-disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"T",
"cell",
"progenitors",
"in",
"the",
"fetal",
"liver",
"and",
"bone",
"marrow",
"migrate",
"through",
"the",
"blood",
"stream",
"to",
"reach",
"the",
"thymus",
",",
"where",
"they",
"develop",
"into",
"mature",
"T",
"lymphoid",
"cells",
"(",
"[",
"@",
"bib38",
"]",
";",
"[",
"@",
"bib14",
"]",
")",
"."
] |
[
"B-cell type",
"I-cell type",
"I-cell type",
"O",
"O",
"B-organ",
"I-organ",
"O",
"B-organ",
"I-organ",
"O",
"O",
"O",
"B-body part",
"I-body part",
"O",
"O",
"O",
"B-organ",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell type",
"I-cell type",
"I-cell type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Early",
"T",
"lineage",
"progenitors",
"(",
"ETPs",
")",
"are",
"the",
"most",
"immature",
"cells",
"in",
"the",
"thymus",
"that",
"have",
"been",
"shown",
"(",
"to",
"date",
")",
"to",
"have",
"developmental",
"potential",
"for",
"complete",
"T",
"lineage",
"development",
"."
] |
[
"B-cell type",
"I-cell type",
"I-cell type",
"I-cell type",
"O",
"B-cell type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-organ",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Spirituality",
",",
"religiousness",
"and",
"coping",
"in",
"patients",
"with",
"schizophrenia",
":",
"A",
"cross",
"sectional",
"study",
"in",
"a",
"tertiary",
"care",
"hospital",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-medical condition",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
Pile-NER-biomed-IOB. After restricting Pile-NER-biomed-IOB to the 24 most frequent biomedical-specific entity types, we perform a quality-control step to ensure consistency and accuracy of annotations. Each sentence is evaluated by a Large Language Model (LLM) quality judge, which assesses the alignment between the annotated entity spans and their textual context. Only sentences judged to have high-quality are retained for the final dataset. This process removes noisy or inconsistent samples, yielding a cleaner and more reliable training set for the domain refinement stage.
| Entity type | Frequency |
|---|---|
| medical condition | 4341 |
| disease | 3270 |
| chemical | 2651 |
| protein | 2460 |
| anatomical structure | 1931 |
| drug | 1176 |
| medical procedure | 1115 |
| cell type | 1045 |
| biological process | 778 |
| organism | 658 |
| symptom | 643 |
| gene | 641 |
| treatment | 597 |
| process | 546 |
| chemical compound | 509 |
| medical test | 468 |
| organ | 455 |
| medical treatment | 328 |
| substance | 317 |
| body part | 251 |
| procedure | 220 |
| medical equipment | 190 |
| anatomy | 174 |
| biological entity | 75 |